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在 Jupyter 中运行 R 和 Python

原文：www.kdnuggets.com/2019/02/running-r-and-python-in-jupyter.html

c 评论

Jupyter 项目始于 2014 年，作为一种面向交互式和科学计算的倡议。

它包含一个 Python 内核，以便用户可以拥有一个新的交互式 IDE 来使用 Python。

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它基于 IPython 计算环境。2015 年，IRkernel 也被添加了对 R 的支持。这使得用户可以使用 R 和 Python 运行内核。

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R 内核安装

如果你使用的是 Windows，下面的方法是可以的。如果你使用的是基于 Unix 的机器（OSX 或 Linux），命令必须在终端中运行。

最好的方法是安装 Anaconda，它会自动安装 Python、R 和 Jupyter Notebooks。

  1. 在安装 Anaconda 后，打开 Anaconda 提示符并输入 install.packages(c(repr, IRdisplay, evaluate, crayon, pbdZMQ, devtools, uuid, digest), type=source)。务必在终端中执行此命令，以便直接从 R 执行，而不是通过 IDE。

  2. 在步骤 1 后，运行 devtools::install_github(IRkernel/IRkernel)，最后运行 IRkernel::installspec(user=FALSE)。

  3. 进入 Anaconda Navigator，打开 Jupyter Notebook，或者在 Anaconda 提示符中输入 jupyter notebook。在 New 下，你应该能找到 R 内核。点击它以在 Jupyter 环境中开始运行 R。

需要注意的是，由于安装 Anaconda 是安装 Jupyter Notebook 的最简单和最快捷的方式，Anaconda 安装的 R 版本滞后于最新发布版本。你不能像从 R 网站单独安装时那样更新 Anaconda 中的 R。这是因为 Anaconda 中的所有程序都由 Conda 包管理器管理，Anaconda 需要更新其默认的 R 版本，然后用户才能安装。因此，在 Jupyter Notebooks 中运行 R 时，某些包可能由于包更新频率比 R 更新频率更高而无法正常工作（尽管这很少见）。

在 Jupyter 中运行 R

现在我们已经在 Jupyter 中安装了 R，我们可以像在任何 R IDE 中一样开始使用 R 代码。

  1. 在上述步骤 3 之后，您将被带到一个新标签页，R 内核已准备好：

    新的 R 内核新的 R 内核

  2. 接下来，为您的内核命名，以便以后能够识别它。只需点击显示“无标题”的地方，您就可以给它命名。之后，您就可以开始在 Jupyter 中使用 R 了。

  3. 在第一个代码块中执行 library(tidyverse), data(mtcars), options(warnings=-1).options(warnings=-1) 将抑制任何警告信息，因此仅在运行代码块后使用它。按下 Windows 中的 Ctrl+Enter 或 Mac 中的 Cmd + Enter 来运行代码块。

    第一个代码第一个代码块

  4. glimpse(mtcars) 提供数据集的概览，包括数据类型和维度，而 summary(mtcars) 生成数据集所有特征的总结统计。

    一瞥和总结mtcars 的一瞥和总结

  5. options(repr.plot.width=5, repr.plot.height=5) 设置全局选项，使绘图的大小按指定的尺寸。如果需要调整不同图的大小，可以将相同的代码行添加到不同的块中，这将导致从该块执行的图进行调整。

    Jupyter 中的 ggplotJupyter 中的 ggplot

Python 内核

现在，Python 在 Jupyter 中变得更加直接。按照上述步骤安装 Anaconda 后，Python 内核是默认安装的。当您打开 Jupyter Notebook 时，转到 新建 --> Python，您将进入 Jupyter 中的 Python 环境。

如果您已经在 R 内核（或其他任何内核）中，请转到 文件 --> 新建笔记本 --> Python 3

切换到 Python 内核切换到 Python 内核

这将带您到浏览器中的新标签页，Python 环境已准备好。现在，您可以同时在 Jupyter 中运行 R 和 Python。您可以同时运行它们，也可以一个接一个地运行（根据您的需求）。

Jupyter 中的 Python 内核Jupyter 中的 Python 内核

结论

这将帮助您开始在 Jupyter 中使用 R 和 Python。您可以像平常一样使用 R。在 Jupyter 中还有更多内容可以探索。即将推出的教程将重点介绍如何使用 Markdown 和 nb-extensions 在 Jupyter 中进行报告。

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